据新华社报道，《苏州港总体规划》（2013至2030年）已经获交通运输部、省政府联合批覆。按照总体规划，至2020年，苏州港港口吞吐量将达6亿吨，到2030年进一步增加至7.5亿吨。

规划明确了苏州港的性质是中国沿海主要港口和综合运输体系的重要枢纽，是上海国际航运中心重要组成部分和集装箱干线港。按照总体规划，苏州港港口岸线86.9公里，其中深水岸线83.7公里，划分为张家港、常熟、太仓叁个港区，形成一港叁区、十四个作业区的总体格局。
其中，张家港港区以服务长江中上游地区物资转运和张家港市临港产业开发为主，重点发展煤炭、铁矿石、粮食等大宗散货和集装箱、液体化工品、件杂货运输，划分为长山、张家港、化学工业园、段山港、冶金工业园、东沙六个作业区，共规划建设206个码头泊位，年设计处理能力为3.6亿吨、320万个20尺柜。
常熟港区以服务于常熟市经济发展和临港产业开发为主，重点发展煤炭、件杂货、液体化工品运输，兼顾集装箱运输功能，划分为兴华、金泾塘、铁黄沙叁个作业区和白茆小沙预留发展区，共规划建设57个码头泊位，年设计通过能力7,500万吨、60万个20尺柜。
太仓港区重点服务于江苏省、苏州市及长江沿线地区，以集装箱干线运输和铁矿石、煤炭中转运输为主，相应开展石油化工品中转贮运，并兼顾太仓市临港产业开发，划分为鹿河、新泾、荡茜、浮桥和茜泾五个作业区，共规划建设163个码头泊位，年设计通过能力3.25亿吨、2,147万个20尺柜。
2012年，苏州港吞吐量录得4.27亿吨，2013年该港吞吐量预计将达到近4.6亿吨。